Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PMS2P11Q13670 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms