Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HTR4Q13639 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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HTR4Q13639 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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HTR4Q13639 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HTR4Q13639 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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