Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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MKRN4PQ13434 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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MKRN4PQ13434 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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MKRN4PQ13434 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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MKRN4PQ13434 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKRN4PQ13434 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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