Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLN3Q13286 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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