Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTP4A2Q12974 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTP4A2Q12974 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTP4A2Q12974 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTP4A2Q12974 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTP4A2Q12974 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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