Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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FOXC1Q12948 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXC1Q12948 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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