Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2AQ12879 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
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GRIN2AQ12879 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
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GRIN2AQ12879 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2AQ12879 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
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