Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBRQ0VD83 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms