Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms