Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP4Q09028 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms