Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR1Q08345 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms