Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LRP1Q07954 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms