Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOS1Q07889 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms