Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDE4BQ07343 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms