Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CHRNEQ04844 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms