Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1Q04771 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms