Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBXN1Q04323 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms