Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CACNB1Q02641 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 LINC01715-201ENST00000420776 624 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CACNB1Q02641 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms