Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXOSC10Q01780 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms