Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCN7AQ01118 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCN7AQ01118 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms