Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms