Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
JAG1P78504 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JAG1P78504 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
JAG1P78504 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
JAG1P78504 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JAG1P78504 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JAG1P78504 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 608.4 ms