Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKP1P63208 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SKP1P63208 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SKP1P63208 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKP1P63208 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKP1P63208 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SKP1P63208 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms