Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB5CP51148 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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RAB5CP51148 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RAB5CP51148 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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