Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRIP1P50238 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms