Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPHP49418 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPHP49418 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPHP49418 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPHP49418 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPHP49418 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPHP49418 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPHP49418 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPHP49418 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPHP49418 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPHP49418 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms