Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NMUP48645 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NMUP48645 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NMUP48645 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms