Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GCLMP48507 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GCLMP48507 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GCLMP48507 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GCLMP48507 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GCLMP48507 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GCLMP48507 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms