Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APOBEC1P41238 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms