Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2IP36954 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2IP36954 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms