Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP5C1P36542 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP5C1P36542 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms