Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP6P35125 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP6P35125 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP6P35125 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP6P35125 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP6P35125 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP6P35125 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP6P35125 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms