Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
HOXA13P31271 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HOXA13P31271 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms