Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF1P30408 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TM4SF1P30408 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms