Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXD10P28358 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD10P28358 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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