Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCL3P20749 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCL3P20749 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCL3P20749 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCL3P20749 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCL3P20749 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCL3P20749 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCL3P20749 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms