Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms