Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP2A2P16615 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms