Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A1P13866 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A1P13866 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms