Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GP1BBP13224 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GP1BBP13224 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms