Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI3P10071 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI3P10071 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI3P10071 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI3P10071 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI3P10071 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI3P10071 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI3P10071 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI3P10071 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI3P10071 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms