Protein–RNA interactions for Protein: P08621

SNRNP70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP70P08621 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP70P08621 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms