Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD2O96028 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD2O96028 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms