Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLDN9O95484 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLDN9O95484 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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