Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5O75197 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5O75197 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5O75197 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5O75197 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LRP5O75197 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRP5O75197 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRP5O75197 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRP5O75197 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LRP5O75197 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms