Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPLO60437 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPLO60437 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPLO60437 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPLO60437 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPLO60437 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPLO60437 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms