Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAK2O60296 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms