Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XRCC2O43543 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XRCC2O43543 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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