Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CTIFO43310 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTIFO43310 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTIFO43310 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTIFO43310 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms