Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VGFO15240 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VGFO15240 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VGFO15240 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VGFO15240 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VGFO15240 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VGFO15240 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VGFO15240 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VGFO15240 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VGFO15240 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VGFO15240 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
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